这场突如其来的巨大爆炸引发的大火，虽然在忍者们的努力下被扑灭了，但是对村子造成的毁坏却已难以弥补。
先不说留下了巨大坑面的土地和被烧毁的树木，就说说那些在爆炸中受伤的暗部成员。他们中有些人距离爆炸地点太近，受伤严重，就算救了回来，估计也只能做普通人度日。
这些被当作了对木叶的蔑视和挑衅。而作为罪魁祸首的大蛇丸自然是逃脱不了被问责。
以四代火影波风水门为首，带领三代火影和长老团对大蛇丸进行审讯。
“大蛇丸，根据暗部搜集到的证据。那里地下有一个巨大的实验室。你在里面研究什么？”水户门炎瞪着大蛇丸，严肃地向他问话。
大蛇丸却露出一个似笑非笑的表情，没有立刻回答。
“请回答问题！”长老团中又有人发话了。
这回大蛇丸终于给了回应。不过他接下来说的话让听到的长老们只希望他们从来没有出现在这里过，也没有问出刚才的问题。
可惜时光不能倒流。
只见大蛇丸抬头环顾了一圈从开始刘一直一言不发的四代和三代火影，又看看迫切希望从他嘴里嘴里获取信息，然后立马定案解决这件事的长老团。
他露出可以称得上充满了恶意的笑容：“那是实验室。研究对象有很多，我觉得你们中有些人应该是了解的。”
“我也是为你们服务的。”大蛇丸的竖瞳闪着光。
他此话一出，整个房间都安静了。压抑的气氛导致在场的人都不好发声。
最后三代火影沙哑这喉咙，问：“爆炸产生的原因呢！到底为什么会发生这么严重的爆炸！不要回避关键问题！”
猿飞日斩一开始还表现得平心静气，他越说到后面，就越是疾言厉色。
这大概就是一个老师对学生的“爱之深，恨之切”吧。
面对老师的问话，大蛇丸沉默了一会儿。这时候他的神情终于正经起来。
看到大蛇丸的神情，三代火影和大部分认都心中一喜，他们以为大蛇丸终于老实可，最后却只能失望收场。
果然，大蛇丸并不打算这么配合三代火影和长老团：“爆炸的原因我也不清楚呢。你们可以自己去那里调查。”
他笑着耸耸肩，余光看了一会儿聪一开始就沉默不语的波风水门。
大蛇丸这时又说了一句看似和会议完全不相关的话：“我还以为暗部由水门掌管。”
他歪着头，眼神特别无辜：“可似乎他们道现在还握在老师你和长老团的手里？”
水门顿时觉得有眼神从四面八方集中到他的身上。但是他并不觉得焦心或者慌乱。反而，水门非常有风度地笑了：“谢谢大蛇丸老师的关心。不过这个问题和本次宣判会没有任何关联。”
“水门，我这是在替你鸣不平呢。”大蛇丸也笑了。
水门这时候并没有立刻回答。他以四代火影的名义让人将大蛇丸扣押起来，然后宣布第二场宣判会的时间。
就在三天后。
大蛇丸被戴上特制的手铐，然后被带走。
水门这时候也宣布宣判会结束。
长老们鱼贯而出，只有三代和水门还留在这个不大不小的房间里。
“水门。”三代不知道从哪里开口。
水门很有耐心地等候着。过了一会儿他听到猿飞日斩这么和他说：“你是木叶的影，是我亲自挑选的人。”
“我将守护木叶的重担托付给你，却没有给你完整的权利，这是我的过失。”他向水门道歉。
“之后暗部的人只会听从你一个人的号令。”三代同时做出保证。
水门微微笑起：“三代大人，我接任火影一职时就将建设更好的木叶作为第一目标。恕我直言，暗部的存在可以很好地协助火影管理村子，却也容易成为长老们掌握在手中的权柄。”
“我会接过暗部的管理。”他说，“但是在我治下，长老团和顾问的地位不变，但是他们对暗部行动的干涉权将不复存在。平您谅解”
水门的话可以说是非常重了，但是猿飞日斩笑了。
他笑得很满意：“这是应该的。”
他当初看中水门，并不只是因为水门在忍界大战中树立的威名，更因为从这个年轻人身上看到了光。
他坚信水门可以带给木叶改变：改变这腐朽的政局，改变这腐朽的时代。
“我没有看错人。”三代火影欣慰一笑。
紧接着他也离开了房间，只留下水门目光沉沉地看着大蛇丸之前站的位置。
实验室的存在长老们真的不知道吗？不见然。
他们只是想要确认爆炸和他们没有关系罢了。所以才表现得这么热切。其实一切都只为了自己。
水门告诉自己：不要着急，迟早有一天这些从根里就腐败的政治会在他手中改变的。
因为暗部管理权的彻底转移，水门的工作量陡然上升。不过尽管如此，他对玖辛奈和太郎的关心不减。
那天从实验室回去之后，水门和太郎对天生牙的问题进行了彻夜长谈。
在确认天生牙会引起爆炸是因为大蛇丸的不正当实验后，水门便不在担心什么。
他反而安慰太郎：“实验室被毁坏的很严重，不会有人看出端倪的。太郎放心就好。”
白柴幼犬漫不经心地舔着前爪的毛毛：“我从来没有担心过。”
水门伸手揉了揉太郎地脑袋笑道：“我自然知道太郎的厉害。所以家里和面具男暂时拜托太郎了。”
大蛇丸实验室的爆炸引发的问题不光是如何对受灾的地方进行重建，有许多被隐藏的秘密也使人猝不及防得摆在台面上。
比如宇智波一族独有的血继界限——写轮眼的研究和移植报告，为什么会出现在大蛇丸的研究笔记上；再比如，根的首领，志村团藏到底和大蛇丸达成了什么协议，为什么会出现在大蛇丸的秘密日记上。
这些被掀开了一个角的秘密让水门无暇顾及面具男，但是他又不能真的放下，只能拜托太郎和自来也了。
可自来也在爆炸发生之后整天精神恍惚靠不住，也就他们家的白柴幼犬可以依靠了。
突然肩负起整个家庭重担的太郎心里五味杂陈：他堂堂大犬妖，竟然沦落到给人类“看家”的地步了。
更诡异的是，他竟然觉得这样还不错？
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